Ως γνωστόν τα win2k δεν έχουν κάποιο τρόπο για να τρέχει αυτόματα το defrag. Έτσι μετά κάποια έρευνα, βρήκα ένα πολύ χρήσιμο σκριπτάκι (vbs) που κάνει ακριβώς αυτή τη δουλειά, μόνο για το 1o drive. Aν έχετε και άλλα, θα πρέπει να το τροποποιήσετε.
Απλά το βάζετε σε κάποιο directory και μετά κάντε "Add Scheduled Task" και το βάζετε να τρέχει όσο συχνά θέλετε:
Κώδικας:
'Automatic Defrag Script for Windows2000

set WshShell = CreateObject("WScript.Shell")

WshShell.Run "dfrg.msc"
WScript.Sleep 1000

While WshShell.AppActivate("Disk Defragmenter") = FALSE
    wscript.sleep 1000
Wend

WshShell.AppActivate "Disk Defragmenter"
WScript.Sleep 200

WshShell.SendKeys "%A"
WScript.Sleep 200

WshShell.SendKeys "D"

While WshShell.AppActivate("Defragmentation Complete") = FALSE
    wscript.sleep 5000
Wend

WshShell.AppActivate "Defragmentation Complete"
WScript.Sleep 200

WshShell.Sendkeys "{TAB}"
Wscript.Sleep 500

WshShell.Sendkeys "{ENTER}"
Wscript.Sleep 500

WshShell.Sendkeys "%{F4}"